O LEPETRO, é composto por 9 unidades laboratoriais de diversas especialidades, permitindo a realização de ensaios e análises laboratoriais nas áreas de geologia, química, microbiologia, geoquímica, petróleo e meio ambiente.
A Unidade de Preparação Física de Amostra possui equipamentos utilizados no preparo de amostras sólidas dentre eles liofilizadores, forno mufla, moinho de bolas e estufa, aplicados na secagem, pulverização e peneiramento de amostras de sedimento, biota e solo para determinações orgânicas e inorgânicas. Nesta unidade são preparadas as amostras que serão analisadas na Unidade de Petrografia Orgânica e Palinofácies, Unidade de Geoquímica, Unidade de Geomicrobiologia, Unidade de Geoquímica Ambiental, Unidade de Geoquímica do Petróleo e Unidade de Cromatografia e Análise Elementar.